唐武宗会昌废佛，景教同时被禁止。后来衰微，元朝再度传入，教徒与来自欧洲的天主教基督徒并称为“也里可温”。元亡后，再次衰落。
景教是否真的存在于北京十字寺
虽然北京十字寺内没有任何关于景教的记录，但在1919年，有个叫哈丁的洋人来到十字寺，在景教的石刻中发现了“十字”。
他仔细观察发现，石刻上所刻花纹非常精美，其中一石刻的下面雕刻著一个十字立在一个莲花座上，十字横笔两端各有一颗桃尖向外的桃形心。石刻左右两侧各雕刻著一隻形状相同的上宽下窄的梯形花盆，左侧花盆裡是一簇荷花，艺术化了的荷叶间是一朵酒盅状破蕾初放的花蕾。花蕾上端是两个盛开的花朵，左端是几隻莲蓬。右侧花盆裡是一簇菊花，茂盛的枝叶将一朵盛开的菊花簇拥於正中。
第二件石刻十字交叉的空白处刻有陌生文字，一时让他困惑不解。后来西方人伯吉特教授辨认出，这是两句古叙利亚文，意思是：“仰望它，寄希望於它。”原本出自《圣经·诗篇》第三十四章5(6)，而同样的古叙利亚文曾出现在一部公元6世纪的叙利亚文《路加福音》手稿封面上，这本书现存於大英博物馆内。
这时人们发现原来这两件石刻是十字寺内的景教遗物，石刻的发现轰动中外学术界，一些基督教研究人士称之為“景教徒的最确实和最有价值的遗物”、“景教东渐史上的伟跡”。
