2、火山喷发
火山喷发时，由于大量岩溶物质被喷出，往往会在喷发中心形成圆形或椭圆形的火山口。世界上最大的火山口位于日本阿苏山，它南北长24千米，东西宽18千米，面积达250平方千米，形成于距今3.3万年前一次剧烈的火山喷发。有人推测，“撒哈拉之眼”可能与阿苏山火山口类似，是由于一次剧烈的火山喷发形成的。
可是，科学家在分析火山成因时发现，这种推测站不住脚。因为，地球上的火山一般都出现在地壳(包括洋壳)开裂处和板块俯冲地带;而“撒哈拉之眼”所处的地方属于大沙漠的一部分，这里既不是地壳开裂处，又非板块俯冲地带，因而不具备火山喷发的条件。
3、地形侵蚀
数十万年前，由于地质运动，沙漠下的岩石受到抬升，从沙土中脱颖而出。岩石层露出地面后，在大自然风吹、日晒、雨淋的侵蚀下，逐渐形成了一个巨大的凹地。由于岩石层的结构不尽一致，有的岩石十分坚硬，有的相对较松软，在相同的自然条件下，坚硬的岩石受侵蚀程度较低，特别是一些硬度较高、不易受侵蚀的古生代石英岩基本保持了原貌。
巧合的是，这些石英岩恰好组成了3个同心圆。于是，这个奇异的地貌便出现了。不过，这只“眼睛”为何这么大、这么圆?还有，古生代石英岩为何独独出现在同心圆的圆弧上?这些谜题，科学家们尚未给出合理的解释。
4、虫洞，通往平行世界之门
还有人认为萨拉之眼是虫洞造成的，许多来此探险的人们有去无回，最恐怖的是人们找不到任何的尸骨。人们怀疑他们或是被虫洞吸引了。虫洞拥有巨大的能量，可以扭曲时间空间，同时也拥有巨大的吸力。由于长时间的吸力导致这里的地貌改变也不是不可能。而他们很可能是误入虫洞，开启了一场平行世界之旅。
而撒哈拉沙漠具有形成虫洞的条件，高温，强烈的辐射，以及急速流动的空气，或还有一些我们不知道的因素。虫洞在这里偶然形成并连接另一个时空，甚至改变了这里的地貌。
