鲸鱼搁浅原因分为人为和自然两种。进数年间，随着科学技术的发展以及人类开发利用海洋程度的不断深化，给海洋生物造成了难以避免的冲击，其中对人的因素首当其冲。但是，进数世纪来，鲸却在北海和部分海岸线搁浅。尽管并非年复一年，但却出现了数目惊人、甚至大面积搁浅的情况。如此成群性地搁浅和死亡成为一大谜。
据科学家们观察，这群搁浅而死的鲸鱼成群性地生活，并非因生老病死而自然消亡，其中健康而无疾病迹象和营养问题。对他们的死也毫无提示。所以对这种搁浅的出现不太可能归咎于人。据科学家研究和观测，这一惨剧可能要“归功”太阳了。
据有关研究表明搁浅和太阳风暴有一定关系。鲸鱼觅食时，向南返回太过匆忙，以致于很容易进入浅水区域。对深海动物而言，浅层水域及环境恶劣水域则根本分辨不清。太阳风暴期间，能量及粒子歪曲了地球磁场。这些能量及粒子撞击地球时会引起磁场波动，以致于影响鲸鱼令其迷路。关于太阳风暴会对鲸鱼搁浅产生影响这一说法，科学家曾发现太阳活动曲线和同期鲸鱼搁浅曲线非常类似，所以鲸鱼搁浅或许和太阳活动有很大关系。
但太阳风暴造成鲸鱼搁浅现在所拥有的只是间接性证据。这种鲸鱼搁浅致死现象在自然界中仍然是个谜。
由于这类鲸鱼均被病菌感染，损害鲸鱼本身免疫功能，致使身体处于脆弱状态，而且这类病菌一般有传染性，最后可使整条鲸鱼群感染传染病并造成集体死亡。
但是，这些病菌、传染病从哪里来？还是人，还是人对海洋造成了严重的污染，海水里弥漫着大量化学物质，病菌迅速滋生，使鲸鱼背负起那本不应该背负的沉痛恶果。
